Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms