Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Fhl3Q9R059 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fhl3Q9R059 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms