Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col4a4Q9QZR9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Col4a4Q9QZR9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Col4a4Q9QZR9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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