Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp21Q9QZL6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms