Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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VapbQ9QY76 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VapbQ9QY76 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms