Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Col5a3Q9JLI2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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