Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tgm1Q9JLF6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tgm1Q9JLF6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms