Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gde1Q9JL56 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms