Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Scamp5Q9JKD3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scamp5Q9JKD3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms