Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpa33Q9JKA5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms