Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gfra4Q9JJT2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms