Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgpep1Q9ESW8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms