Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
OtofQ9ESF1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
OtofQ9ESF1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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