Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tfcp2Q9ERA0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms