Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Capn12Q9ER56 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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