Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpgrip1Q9EPQ2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms