Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rnf6Q9DBU5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Rnf6Q9DBU5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Rnf6Q9DBU5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf6Q9DBU5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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