Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Pop5Q9DB28 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Pop5Q9DB28 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pop5Q9DB28 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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