Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TrmuQ9DAT5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TrmuQ9DAT5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TrmuQ9DAT5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrmuQ9DAT5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrmuQ9DAT5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms