Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmem239Q9DA47 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms