Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf138rt1Q9D9M9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms