Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hcfc2Q9D968 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hcfc2Q9D968 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms