Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Snx5Q9D8U8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Snx5Q9D8U8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms