Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms