Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D8N1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D8N1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms