Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q9D7E4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms