Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tube1Q9D6T1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tube1Q9D6T1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tube1Q9D6T1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tube1Q9D6T1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tube1Q9D6T1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms