Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb4aQ9D6F9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tubb4aQ9D6F9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms