Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9bQ9D6E4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc9bQ9D6E4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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