Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Zcchc13Q9D548 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms