Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gcc1Q9D4H2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gcc1Q9D4H2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms