Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Iqcf3Q9D498 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms