Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krtap5-3Q9D226 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms