Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmem53Q9D0Z3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms