Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc47Q9D024 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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