Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shmt2Q9CZN7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Shmt2Q9CZN7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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