Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mis12Q9CY25 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms