Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Sgo1Q9CXH7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms