Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

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Length 1,231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Alpk1Q9CXB8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alpk1Q9CXB8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alpk1Q9CXB8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms