Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpusd4Q9CWX4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms