Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd12Q9CWU0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Tdrd12Q9CWU0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms