Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg12Q9CQY1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms