Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim8Q9CQQ0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms