Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Higd2aQ9CQJ1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms