Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms