Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms