Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms