Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SrrtQ99MR6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms