Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gins4Q99LZ3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms