Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ubxn2aQ99KJ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms